Påvisning av SARS-CoV-2 RNA med polymerasekjedereaksjon (PCR). På grunn av store prøvemengder har laboratoriet etablert og tatt bruk 3 ulike PCR-metoder med ulike kombinasjoner av målgen. Testegenskapene er gode for alle metodene. 

I tillegg har UNN tatt i bruk PCR-hurtigdiagnostikk for SARS-CoV-2 (GeneXpert) til pasienter hvor det er viktig med rask avklaring. Dette er pasientnær diagnostikk hvor instrumentene er plassert og administrert på utpekte avdelinger (utenfor Avdeling for mikrobiologi og smittevern). 

Utvalgte positive prøver med tilstrekkelig mengde virus-RNA vil bli nærmere karakterisert. Laboratoriets leger avgjør hvilke prøver som skal karakteriseres avhengig av kliniske opplysninger og epidemiologisk bakgrunn. Et fast antall vil også inngå i ukentlig nasjonal overvåkning. Nærmere karakterisering kan omfatte S-gen-variantscreening og/eller sekvensering av deler eller hele genomet. I slike tilfeller vil rekvirenten motta separat svar.