Forlengelse av APTT gjenspeiler redusert koagulasjonsevne i den "interne " del av koagulasjons-systemet. Blødersykdommene (Hemofili A- og B) gir kraftig forlengelse av APTT. En svært sjelden, men alvorlig årsak til forlenget APTT er inhibitor (antistoff) mot koagulasjonsfaktor (hyppigst Faktor VIII). Ved mild faktormangel, ved von Willebrands sykdom og ved platedefekter kan sees normal APTT.

Ved ukjent forlenget APTT, kan det etter avtale med laboratoriet bestilles APTT miksing. Da utfører laboratoriet miksing av pasientens plasma med normalplasma. Ved faktormangel vil APTT normaliseres. Ved inhibitorer vil APTT ikke normaliseres. 

APTT brukes hyppig for kontroll av ufraksjonert Heparin-behandling, selv om anti-Xa metode er mer nøyaktig. Andre antikoagulasjonsmidler som kan gi forlenget APTT er Warfarin og direkte perorale antikoagulantia (Dabigatran, Rivaroxaban, Apixaban), men APTT er ikke egnet til monitorering av disse. Lett økning av APTT kan sees i andre situasjoner, bl.a. under lavmolekylær Heparin-behandling, og tilstedeværelse av antifosfolipid-antistoffer.